潔凈廠房因其對溫度和濕度環境的特殊要求，其設計范疇一般包括潔凈室地面、墻板、吊頂、及配套的空調、照明、消防、給排水等與潔凈室相關的內容。
潔凈廠房的設計規范一般包括：工藝平面布置、生產工藝和空氣潔凈度、隔間設計規范、人員凈化和物料凈化、噪聲控制、微振控制、專用消防口等方面。
具體設計規范請查閱《潔凈廠房設計規范》（GBJ50073-2001）、《潔凈室施工及驗收規范》（JGJ71-90）、《暖通風與空氣調節設計規范》（GBJ19-87）、《建筑設計防火規范》（GBJ16-87）、《工業企業噪聲控制設計規范》（GBJ87－85）、《工業企業照明設計標準》（GB50034-92），且根據企業自身實際需求，合理設計制定。
對于要求不是很高的高大潔凈廠房，可以采用簡化裝修的做法來實現，既可以滿足使用要求，又能滿足潔凈度的要求。
